5% af de gennemførte projekter bliver udtaget til kontrolbesøg, hvor der, foruden den fysiske besigtigelse af projektet, også sker en kontrol af fakturaer, betalingsdokumentation og regnskabsbilag.
De resterende 95% af projekterne afsynes, for at sikre at projekterne er gennemført i overensstemmelse med tilsagnet.
Kontrolbesøget foretages af Landbrugsstyrelsen, eller anden med bemyndigelse, og finder sted uden retskendelse. Kontrolløren skal altid vise legitimation ved kontrolbesøg.
Til brug i kontrollen kan vi indhente oplysninger fra andre offentlige myndigheder i et nødvendigt omfang, som er i overensstemmelse med landdistriktsloven § 12. Det er tilsagnsmodtagers opgave at sikre, at kontrolmyndigheden har adgang til at besigtige investeringsprojektet og får den fornødne vejledning og hjælp ved kontrollens gennemførelse.
Fra den 1. januar 2026 sker der, på grund af overgangen til den nye landbrugsreform, en ændring i den måde kontrollerne gennemføres på, men den nye kontrolmodel er endnu ikke endeligt fastlagt.